首先说明：我使用openslide-matlab主要是为了处理全扫病理图像，提取数据集，由于全扫描的病理图像其数据量非常大，处理不方便，需要依赖openslide。下面就将介绍具体步骤： matlab版本openslide安装 1.下载openslide-matlab的包，github上有https://github.com/fordanic/openslide-matlab 2.run openslide-matlab中的openslide-load-library.m文件 出现报错：libopenslide.so.0 not availiable on the MATLAB path 解决方法：locate libopenslide.so.0 找到文件在机子中的位置（’/usr/loacl/lib/libopenslide.so.0’） 将openslide-load-library.m文件中第45行换成libopenslide.so.0的地址 3.继续 run opendslide-load-library.m 会出现libopenslide.h not availiable on the MATLAB path 解决方法：locate libopenslide.h 在第53行改为：openslideHeaderLocation=（‘/usr/local/include/opendslide/openslide.h’)； 4.继续run opendslide-load-library.m就会没有问题了 5.测试：run openslide-example.m应该就会没有问题了
补充说明：在第二步的时候可能会没有用还会说找不到 解决方法：将第47行改为：if isempty(‘/usr/loacl/lib/libopenslide.so.0’)
python版本的openslide安装： 1.下载openslide，进行解压 2.安装一些必要的安装库：zlib, libpng, libjpeg, libtiff, OpenJPEG 1.x or >= 2.1,GDK-PixBuf, libxml2, SQLite >= 3.6.20, cairo >= 1.2, and glib >= 2.16 3.命令安装这些库： 1. sudo apt-get install libopenjpeg-dev libsqlite3-dev 2. sudo apt-get install openslide-tools 3. sudo apt-get install python-openslide 4. sudo apt-get install python3-openslide
4.进入到openslide的下面 （1）cd到文件夹下面 （2）./configure 1. make 2. make install 按照步骤安装 5.测试 1. import openslide 2. import numpy 3. import matplotlib.pyplot as plt 4. 5. slide = openslide.open_slide(“/xxx.tif”) 6. ds = slide.level_downsamples 7. for i in xrange(slide.level_count): 8. size = int(4096*(ds[0]/ds[i])) 9. tile = numpy.array(slide.read_region((300,1100), i, (size,size) )) 10. plt.figure() 11. plt.imshow(tile) 12. plt.show()
在和Python结合的时候注意一些python依赖库的安装，在.py文件当中，import导入库的时候出现红色波浪线说明没有此库需要安装，安装方法： pip install 库名
