生物信息学分析常用网站

xiaoxiao2021-02-28  520

1.  BLAST(核酸蛋白序列比对):

https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

2.  miRBasemiRNA数据库网站):

http://www.mirbase.org/

3.  PlantCARE(启动子元件分析网站):

    http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/

4.  Weblogo(核酸蛋白序列位点保守性分析):

http://weblogo.berkeley.edu/logo.cgi

5.  CBS Prediction Servers(综合分析,强烈推荐)

http://www.cbs.dtu.dk/services/

其中比较常用的有:

     Promoter 2.0 Prediction Server(转录起始位点预测)

http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/

SignalP 4.1 Server(信号肽预测)

http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/

  TargetP 1.1 Server(亚细胞定位预测)

http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP/

  TMHMM Server v.2.0(蛋白跨膜结构预测)

http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/

6.  SWISS-MODEL(蛋白三维建模)

https://swissmodel.expasy.org/

7.  RNA22miRNA靶基因预测)

https://cm.jefferson.edu/rna22/

8.  PDB(蛋白质数据库)

http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

9.  RNAfold web serverRNA二级结构预测)

http://nhjy.hzau.edu.cn/kech/swxxx/jakj/dianzi/Bioinf4/miRNA/miRNA1.htm

10.TAIR(拟南芥数据库)

http://www.arabidopsis.org/

11.文献搜索(农大没有版权的文献下载)

http://www.sci-hub.cc/

12.生物序列的可视化示意图制作(IBS

http://ibs.biocuckoo.org/

13.InterPro(蛋白质序列分析)

http://www.ebi.ac.uk/interpro/

14.RNA结合蛋白预测

RNA binding motif (RRM) containing

http://www.genenames.org/genefamilies/RBM

RBPmap

http://rbpmap.technion.ac.il/

RNApred

http://www.imtech.res.in/raghava/rnapred/help.html

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