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转录组测序所得的数据,怎样传到NCBI的SRA数据库? [复制链接]

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发表于 2016-6-29 21:50:51 |显示全部楼层




随着高通量测序的发展,海量的数据源源不断的产生,以至于美国国家生物技术信息中心(NCBI)都受不了了,由于经费不足,于2011年2月关闭了Sequence Read Archive(SRA)数据库,停止接受用户提交的下一代测序数据。近日,Google和TPG Biotech联合投资1500万美元致力于打造DNA云数据库,Google将和DNAnexus一起接管NCBI的海量数据库,继续为科研人员提供免费的DNA数据信息。上海生物信息技术研究中心参考NCBI和相关仪器的公司共同制定的一套标准建立了SRA数据库用于存储这类数据。SRA数据库是由上海生物信息技术研究中心下属的生物信息科学数据共享平台建立及维护。SRA数据库接受研究者、研究组织以及专利申请者提交的数据 并予以发布,有米用户可以通过FTP批量提交数据(http://lifecenter.sgst.cn/sra/cn/srasubmitPage.do)。   详细提交步骤请打开网页按照要求操作。
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